Robotniks Forschung wurde von der Vereinigten Föderation (der Schall Äquivalent der Vereinigten Staaten). Ursprünglich war es als Mittel zur Erschaffung einer lebenden Waffe geplant, obwohl Robotniks persönliche Motivation darin war, Maria zu retten. Während seiner Forschung erschuf Robotnik zwei unsterbliche Wesen: Shadow und einen riesigen reptilartigen Prototyp mit dem Namen Biolizard. Im Anders als Shadow war der Biolizard gewalttätig und unkontrollierbar, ein Und als die Vereinigte Föderation davon Wind bekam, wurde beschlossen, das Projekt einzustellen und jeden zu eliminieren, der davon wusste. Eine Truppe von GUN-Soldaten (Guardian Unit of Nations) wurde auf die Station entsandt, um Robotnik festzunehmen, Forscher zu töten und Zivilisten zu evakuieren. Eine Zivilistin geriet jedoch ins Kreuzfeuer: Maria.
Verschiedene Versionen von Shadows Geschichte in den Spielen und im erweiterten Universum stellen Marias Tod unterschiedlich dar. Das Spiel von 2005 Shadow der Igel zeigt, wie ein bewaffneter Soldat sie kaltblütig erschießt, während die Sonic X Im Anime wird gezeigt, wie er sie tötet, als sie sich weigert, seinen Befehlen Folge zu leisten. Was hat sie getan, das sie so anstößig fanden? Sie hat Shadow zur Erde geschickt, um ihn vor der Schlachtung zu retten.
Mit ihrem letzten Atemzug bittet sie Shadow, der Menschheit Hoffnung zu bringen, während er in einer Rettungskapsel zur Erde geschickt wird. Man könnte meinen, dieser Wunsch hätte dazu geführt, dass Shadow die Welt rettet, anstatt zu versuchen, sie zu zerstören. Also, was ist passiert?
Wie überall offenbart wird Sonic Adventure 2Robotnik wurde nach dem Verlust von Maria und seiner Forschung verrückt. Obwohl er von GUN gefangen gehalten wurde und seine Arbeit unter strengerer Aufsicht fortsetzte, begann der Doktor, seine Rache zu planen. Wenn er Maria nicht retten könne, würde er die Menschen vernichten, die ihm alles genommen hätten. Dazu gehörte auch, Shadow einer Gehirnwäsche zu unterziehen, damit er Marias letzten Wunsch vergesse und ihn stattdessen fälschlicherweise daran erinnere, als hätte sie ihn um Rache gebeten.
Shadow wurde schließlich von GUN gefangen genommen und in Stasis versetzt, wo er 50 Jahre lang verblieb. Nach all den Jahren wurde er schließlich von Eggman aufgeweckt und manipulierte den Doktor, sodass er alle sieben Chaos Emeralds zu den Überresten von Space Colony Ark brachte, und behauptete, er wolle die Energie der Steine zu nutzen, um die mächtige Eclipse-Kanone der Station anzutreiben und die Menschen der Erde zu unterwerfen und zu drohen. Doch in Wahrheit war sein Plan vorhanden, die Station mit den Smaragden auf Kollisionskurs mit dem Planeten zu bringen und diesen Planeten und die gesamte Menschheit zu zerstören.
Auch Shadow hätte es fast geschafft, bevor er von Sonics Nicht-Freundin Amy Rose an Marias letzten Wunsch erinnert wurde. Anschließend schloss er sich dem Rest unserer Helden an, um den Abstieg der Ark zu verhindern, indem er die Chaos Emeralds nutzte, um den Biolizard zu besiegen, der aus seiner Gefangenschaft in den Tiefen der Station befreit worden war. Nachdem er all seine Kraft eingesetzt hatte, um die Ark zu stabilisieren, fiel er auf die Erde. Der Rest unserer Helden trauerte um ihn, feierte jedoch, dass er Marias Wunsch erfüllen konnte.